L'APSR dispose de différents moyens d'action, tels :

- des contacts avec les ministères chargés de la Santé, de l'Emploi et de l'Education nationale, à tous les échelons nécessaires, ainsi qu'avec les écoles, instituts, facultés, établissements de formation… ;

- une collaboration avec d'autres associations ou organismes aidant les réfugiés pour l'hébergement, les soins médicaux, l'aide sociale, l'aide juridique, les démarches administratives, les bourses d'études…;

- un système d'information concernant les professionnels de santé réfugiés dans leur parcours en France ;

- des antennes régionales relayant localement les actions de l'association ;

- la participation aux commissions ministérielles chargées de l'examen des dossiers des médecins, chirurgiens-dentistes, sages-femmes et pharmaciens qui demandent l'autorisation d'exercer en France — dans ce cadre l'APSR guide les réfugiés au cours de la préparation de leur candidature et apporte aux commissions des compléments d'information sur les cas individuels ainsi que sur la situation générale des réfugiés.

L'activité de l'APSR est assurée par un groupe de bénévoles et par une salariée. Ses ressources financières résultent des cotisations de ses adhérents et de dons, ainsi que de subventions publiques ou privées.